MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6003	NC_012943	TGG	2	6	248319	248324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797130
6004	NC_012943	GGC	2	6	248337	248342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797130
6005	NC_012943	TGG	2	6	248348	248353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797130
6006	NC_012943	GAA	2	6	248377	248382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797130
6007	NC_012943	GCA	2	6	248424	248429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797130
6008	NC_012943	AGC	2	6	248498	248503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797130
6009	NC_012943	AGCC	2	8	248506	248513	25 %	0 %	25 %	50 %	253797130
6010	NC_012943	TCGCCA	2	12	248562	248573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253797130
6011	NC_012943	ACC	2	6	248609	248614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797130
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6013	NC_012943	AGG	2	6	248681	248686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797130
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6016	NC_012943	GCAT	2	8	248822	248829	25 %	25 %	25 %	25 %	253797130
6017	NC_012943	TGG	2	6	248837	248842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797130
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6019	NC_012943	CGG	2	6	248900	248905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_012943	CTG	2	6	248917	248922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_012943	CGG	2	6	248933	248938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_012943	CCA	2	6	248947	248952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_012943	GAAC	2	8	248957	248964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_012943	TCG	2	6	249004	249009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797131
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6029	NC_012943	GC	4	8	249132	249139	0 %	0 %	50 %	50 %	253797131
6030	NC_012943	TCG	2	6	249159	249164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797131
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6055	NC_012943	TGA	2	6	250078	250083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797132
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6057	NC_012943	TGG	2	6	250104	250109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797132
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6102	NC_012943	CGA	2	6	251760	251765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797133
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6122	NC_012943	GAC	2	6	252605	252610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797133
6123	NC_012943	CTT	2	6	252670	252675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797133
6124	NC_012943	GCC	2	6	252731	252736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797133
6125	NC_012943	CGA	2	6	252769	252774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797133
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6127	NC_012943	GCA	2	6	252811	252816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797133
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6131	NC_012943	GCA	2	6	253024	253029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797133
6132	NC_012943	CCG	2	6	253068	253073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797133
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6146	NC_012943	CGCA	2	8	253566	253573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_012943	GCG	2	6	253613	253618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797134
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6154	NC_012943	CGTC	2	8	253764	253771	0 %	25 %	25 %	50 %	253797134
6155	NC_012943	GTG	2	6	253797	253802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797134
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6230	NC_012943	GCC	2	6	257135	257140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797136
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6241	NC_012943	TGC	2	6	257623	257628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6243	NC_012943	CCG	2	6	257727	257732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797137
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6364	NC_012943	CCG	2	6	263139	263144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797142
6365	NC_012943	CGA	2	6	263160	263165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797142
6366	NC_012943	CCA	2	6	263207	263212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797142
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6368	NC_012943	ATCG	2	8	263325	263332	25 %	25 %	25 %	25 %	253797142
6369	NC_012943	CGG	2	6	263424	263429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797142
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6372	NC_012943	GTCG	2	8	263547	263554	0 %	25 %	50 %	25 %	253797142
6373	NC_012943	GGT	2	6	263559	263564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797142
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6375	NC_012943	TCG	2	6	263621	263626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797142
6376	NC_012943	TGCACA	2	12	264063	264074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253797143
6377	NC_012943	GACA	2	8	264107	264114	50 %	0 %	25 %	25 %	253797143
6378	NC_012943	GC	3	6	264277	264282	0 %	0 %	50 %	50 %	253797143
6379	NC_012943	G	6	6	264286	264291	0 %	0 %	100 %	0 %	253797143
6380	NC_012943	CGA	2	6	264304	264309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797143
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6387	NC_012943	CGA	2	6	264777	264782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797143
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6391	NC_012943	CGA	2	6	264955	264960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797143
6392	NC_012943	CCA	2	6	265015	265020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797143
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6395	NC_012943	CG	3	6	265158	265163	0 %	0 %	50 %	50 %	253797143
6396	NC_012943	CCG	2	6	265221	265226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797143
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6402	NC_012943	CGATG	2	10	265582	265591	20 %	20 %	40 %	20 %	253797144
6403	NC_012943	GTTC	2	8	265647	265654	0 %	50 %	25 %	25 %	253797144
6404	NC_012943	GTC	3	9	265697	265705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797144
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6426	NC_012943	TTG	2	6	266567	266572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797145
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6428	NC_012943	GCC	3	9	266632	266640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797145
6429	NC_012943	CTC	2	6	266659	266664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797145
6430	NC_012943	GCT	2	6	266700	266705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797145
6431	NC_012943	CGG	2	6	266746	266751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797145
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6444	NC_012943	AGT	2	6	267348	267353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797145
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6453	NC_012943	TGC	2	6	267541	267546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797145
6454	NC_012943	CGG	3	9	267567	267575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797145
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6457	NC_012943	TCG	2	6	267739	267744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6463	NC_012943	CGG	3	9	267947	267955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797146
6464	NC_012943	ACG	2	6	267968	267973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797146
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6472	NC_012943	GCCGG	2	10	268254	268263	0 %	0 %	60 %	40 %	253797146
6473	NC_012943	CGG	2	6	268280	268285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797146
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6478	NC_012943	TG	3	6	268411	268416	0 %	50 %	50 %	0 %	253797146
6479	NC_012943	GCCA	2	8	268417	268424	25 %	0 %	25 %	50 %	253797146
6480	NC_012943	TGC	2	6	268440	268445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797146
6481	NC_012943	GCC	2	6	268453	268458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797146
6482	NC_012943	GCT	2	6	268487	268492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797146
6483	NC_012943	CAG	2	6	268509	268514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797146
6484	NC_012943	AGCG	2	8	268519	268526	25 %	0 %	50 %	25 %	253797146
6485	NC_012943	CG	3	6	268543	268548	0 %	0 %	50 %	50 %	253797146
6486	NC_012943	TCTGC	2	10	268607	268616	0 %	40 %	20 %	40 %	253797147
6487	NC_012943	TGC	2	6	268626	268631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797147
6488	NC_012943	G	6	6	268660	268665	0 %	0 %	100 %	0 %	253797147
6489	NC_012943	CGCT	2	8	268738	268745	0 %	25 %	25 %	50 %	253797147
6490	NC_012943	CGG	2	6	268798	268803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797147
6491	NC_012943	GTC	2	6	268892	268897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797147
6492	NC_012943	TGT	2	6	268932	268937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797147
6493	NC_012943	CGG	2	6	268943	268948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797147
6494	NC_012943	CTGGTA	2	12	268952	268963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253797147
6495	NC_012943	GAT	2	6	269002	269007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797147
6496	NC_012943	TCGGC	2	10	269011	269020	0 %	20 %	40 %	40 %	253797147
6497	NC_012943	GTCGA	2	10	269027	269036	20 %	20 %	40 %	20 %	253797147
6498	NC_012943	TGT	2	6	269037	269042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797147
6499	NC_012943	AGCG	2	8	269123	269130	25 %	0 %	50 %	25 %	253797147
6500	NC_012943	CGA	2	6	269155	269160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797147

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